中醫(yī)學(xué)的歷史，是學(xué)術(shù)不斷發(fā)展、不斷創(chuàng)新的歷史。自中華人民共和國成立以來，在中目共產(chǎn)黨和中華人民共和國政府的關(guān)懷下，中醫(yī)學(xué)理論取得了長足的進步，在研究的廣度和深度及方法上均超過了歷史任何時期。當(dāng)代中醫(yī)學(xué)理論的研究，以系統(tǒng)整理、發(fā)揚提高為前B，運用傳統(tǒng)方法和現(xiàn)代科學(xué)方法，多學(xué)科多途徑地逐步揭示了中醫(yī)學(xué)理論的奧秘，使中醫(yī)學(xué)理論出現(xiàn)了不斷深化、更新，并有所突破的態(tài)勢。
在中醫(yī)學(xué)文獻的系統(tǒng)整理與研究方面，以中醫(yī)高等院校統(tǒng)編教材《中醫(yī)基礎(chǔ)理論》《中醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)》為標(biāo)志，構(gòu)筑了中醫(yī)基礎(chǔ)理論的基本體系。闡釋經(jīng)旨，賦予新義，開拓新境的《陰陽五行》《中醫(yī)學(xué)概論》《實用中醫(yī)基礎(chǔ)學(xué)》《氣血論》等許多論著和佳篇，則反映了中醫(yī)學(xué)理論水平的提高。
在中醫(yī)學(xué)理論的研究方法上，除運用文獻方法研究中醫(yī)學(xué)理論的本源，進一步揭示其學(xué)術(shù)內(nèi)涵外，利用多學(xué)科知識和方法研究中醫(yī)學(xué)理論則是當(dāng)代中醫(yī)學(xué)理論研究的重要特點。中醫(yī)基礎(chǔ)理論蘊含著現(xiàn)代自然科學(xué)中某些前沿理論的始基，為哲學(xué)、天文學(xué)、氣象學(xué)、數(shù)學(xué)、物理學(xué)、系統(tǒng)科學(xué)、生命科學(xué)等，提供了一些思維原點或理論模式。諸如《內(nèi)經(jīng)的哲學(xué)與中醫(yī)學(xué)的方法》的問世，以及泛系理論與辨證論治、天文學(xué)與五運六氣、太極陰陽理論、運氣與氣象、控制論與治法理論、氣與場、氣與量子力學(xué)等研究成果的發(fā)表，使中醫(yī)學(xué)理論研究與當(dāng)代前沿科學(xué)相溝通，具有強烈的時代特點和創(chuàng)新意識。
運用現(xiàn)代醫(yī)學(xué)及其他現(xiàn)代科學(xué)知識和方法，特別是實驗方法，研究中醫(yī)學(xué)的臟象、經(jīng)絡(luò)、氣血、證候、診法、治法等，使中醫(yī)基礎(chǔ)理論研究的方法從經(jīng)學(xué)的、經(jīng)驗的、自然哲學(xué)的方法上升為現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)方法，初步闡明了中醫(yī)學(xué)理論某些概念、原理的科學(xué)內(nèi)涵。如從肌電、皮膚溫度、皮膚電阻、血流圖、超聲波、激光及同位素追蹤、微觀解剖、內(nèi)分泌、神經(jīng)化學(xué)等多方面研究，證實了經(jīng)絡(luò)現(xiàn)象是客觀存在的。關(guān)于經(jīng)絡(luò)的實質(zhì)，則提出了神經(jīng)體液說、低阻抗說、皮層內(nèi)臟相關(guān)說、第三平衡系統(tǒng)論、波導(dǎo)論和液晶態(tài)說等學(xué)說，這些學(xué)說尚有待進一步驗證、探索。中醫(yī)學(xué)臟象學(xué)說的研究，通過臨床觀察，特別是動物實驗，在探討中醫(yī)臟腑的實質(zhì)方面，取得了一定的進展，尤以脾腎研究為多。研究資料表明：在腎陽虛時，下丘腦-垂體-腎上腺皮質(zhì)、下丘腦-垂體-性腺、下丘腦-垂體，甲狀腺三軸出現(xiàn)功能紊亂與低下，腎陽虛證的主要發(fā)病環(huán)節(jié)是下丘腦的調(diào)節(jié)功能紊亂。脾虛則與胃、腸、胰等整個消化系統(tǒng)功能減退、免疫功能障礙、植物神經(jīng)系統(tǒng)紊亂、，生物膜的結(jié)構(gòu)與功能異常有關(guān)。其他對肝、心、肺的研究也取得了舉世矚目的成就。
為了推動中醫(yī)學(xué)理論研究的發(fā)展，中國政府已把中醫(yī)臟象學(xué)、病因?qū)W、辨證學(xué)、診法及治則治法、養(yǎng)生學(xué)、動物造模、經(jīng)絡(luò)研究、針刺麻醉機理研究以及文獻研究等內(nèi)容列入“九五”、“十五”期間國家中醫(yī)藥科研規(guī)劃。
中醫(yī)學(xué)理論研究已成為世界性的研究課題，各國學(xué)者多有建樹。當(dāng)代中醫(yī)學(xué)理論研究成就非凡，隨著研究的不斷深入，中醫(yī)學(xué)理論研究也必將取得重大突破，為生命科學(xué)的發(fā)展作出自己的貢獻。
