蜈蚣與全蝎，二者藥性相似，均入肝經，同為熄風止痙的要藥。二者常常作為藥對配伍使用，以提高熄風止痙、通絡止痛的效果。
在中醫治療中，就常常會這樣開方子。比如治療癲癇，全蝎連尾用、蜈蚣去頭足，各等量，曬干研成粉末，用蜜制丸，成人每日服4.5～7.2克，早晚分兩次服用。治療肺結核：炙全蝎、紫河車各120克，炙蜈蚣、地鱉蟲各60克，甘草30克，研為細末，每服4克，一日3次。治療偏頭痛：全蝎20克，天麻、紫河車各15克，共研成細粉，分作20包，每服1包，一日2次。治療丹毒：全蝎30克，炮山甲45克。共研極細末，每服4.5克，每日1次。皆有不錯的臨床效果。
在經典古方中，《證治準繩》中的撮風散，二藥加用鉤藤、僵蠶等，治療小兒撮口，手足抽搐。常用驗方中，止痙散將二藥研粉服用，治療痙攣抽搐。
浙江省名中醫詹學斌，用全蝎、蜈蚣配合天竺黃、制膽星、郁金等，組成抗癇湯，治療癲癇，收效顯著。筆者在治療小兒癲癇時，蜈蚣、全蝎為必用，配用地龍、蟬衣、龍骨等，先是煎水喝，病情穩定后，再制成丸藥進行鞏固性治療，積累了十數個案例。
目前市面上有一種常見的成藥——通心絡膠囊，就是全蝎、蜈蚣同用，配用人參、水蛭、檀香等制成的，可用于冠心病心絞痛屬心氣虛乏、血瘀絡阻證以及氣虛血瘀絡阻型中風病。
