呼吸運動與五臟調節，“肺在諸臟之上，而諸臟之氣咸由之吐納也”（《圖書編》）。肺主呼吸，吸之則滿，呼之則出，一呼一吸，消息自然，司清濁之運化，為人身之橐籬。
腎主納氣，肺所吸人之清氣有賴腎的攝納，防止呼吸淺表。肺為氣之主，腎為氣之根，肺主出氣，腎主納氣，陰陽相交，呼吸乃和。肝主疏泄，調暢氣機。肝為剛臟而主疏泄，肺為嬌臟而主肅降。肝從左升，肺從右降，升降得宜則氣機舒展。脾主運化，水谷精氣由脾上升，與肺的呼吸之氣相合而生成宗氣。宗氣走息道而行呼吸，貫心脈以行氣血。脾臟不僅調節氣的運行，而且調節氣的質量。心主血，血為氣之母，氣非血不和，氣不得血，則散而無統，血是氣的載體，并給氣以充分營養。吸人肝與腎，呼出心與肺。因為五臟都參與呼吸氣機的調節，所以五臟中任何一臟的功能異常，均可引起呼吸系統疾病，故曰：“五臟六腑皆令人咳，非獨肺也”（《素問·咳論》）。
