中醫學理論體系是由有關事物互相聯系、互相制約而構成的一個整體。科學理論體系是由基本概念、基本原理或定律和具體的科學規律三個基本知識要素組成的完整體系。如愛因斯坦所說,“理論物理學的完整體系是由概念、被認為對這些概念最有效的基本定律,以及用邏輯推理得到的結論這三者所構成的”。
中醫學理論體系是由中醫學的基本概念、基本原理,以及按照中醫學邏輯演繹程序從基本原理推導出來的科學結論,即科學規律而構成的,是以中國古代的唯物論和辯證法思想,即氣一元論和陰陽五行學說為哲學基礎,以整體觀念為指導思想,以臟腑經絡的生理和病理為核心,以辨證論治為診療特點的獨特的醫學理論體系。