北京協和醫院心內科歷史悠久，是我國心血管病學科發展的搖籃。1921年6月北京協和醫院使用弦線式心電圖機記錄了中國第一例心電圖，1931年北京協和醫院董承瑯醫師等建立了我國歷史上第一個心臟病科，包括心臟病專科門診和心臟臨床生理實驗室。抗日戰爭后，1948年北京協和醫院內科心臟病專業組重新組建，將老式弦線式心電圖機升級改造為國內首臺12導聯心電圖機，并在全國推廣應用，極大推動了我國心臟病學的發展。1951年北京協和醫院黃宛、方圻等醫師在國內率先開展右心導管檢查，診斷和評估先天性心臟病、風濕性心瓣膜病和縮窄性心包炎等疾病，為介入心臟病學的發展和血液動力學監測的應用奠定了基礎。1979年成立大內科建制下的心臟病專業組并進入快速發展階段。急性心肌梗死的靜脈溶栓治療、心臟電生理射頻消融和起搏治療、心臟超聲診斷、冠狀動脈介入診斷和治療、心血管臨床藥理等臨床工作相繼開展。1993年北京協和醫院內科心臟病專業組改稱心內科。
進入21世紀，心內科在多個專業方向蓬勃發展。心律失常射頻消融治療緊隨前沿，對復雜心律失常，如房顫、非經典房撲、疤痕相關性室速等治療有成熟經驗；通過心臟轉復除顫器對心源性猝死高危病人進行猝死的一級預防和二級預防。冠心病介入治療方面積極地將國際先進技術和操作理念應用于臨床工作，在全國率先建立了急性心肌梗死的綠色通道，組建了急救介入隊伍24小時隨叫隨到。心內科保持對內科和心血管系統各種疑難復雜及危重病例深入探尋病因的傳統，結合心臟影像、心肌病理、基因分子診斷等多項前沿技術，大幅提高了北京協和醫院疑難心血管疾病的診療水平，積累了大量危重、疑難、罕見心血管疾病的成功救治經驗，形成“協和”特色。
目前心內科已建立了高血壓和血脂代謝異常、心力衰竭、動脈粥樣硬化、心律失常、肺血管疾病、血栓性疾病、結構性心臟病、腫瘤心臟病、心臟影像等亞專業組，各專業組都有經驗豐富、梯隊整齊的專家為患者提供服務。近年來，張抒揚教授牽頭建立了全國罕見病隊列項目和注冊登記平臺，其中心血管罕見病隊列已初具規模，疑難罕見心血管疾病的精準診治水平在國內領先，也培養了一支專注心血管系統罕見病的優秀中青年醫護人才隊伍，推動了新藥和孤兒藥對罕見病患者的臨床應用。
心內科長期以來非常重視人才梯隊建設和學術帶頭人的培養。歷任學科帶頭人分別為黃宛教授、方圻教授、金蘭教授、吳寧教授、游凱教授、紀寶華教授、戴玉華教授、朱文玲教授， 方全教授、張抒揚教授、嚴曉偉教授、方理剛教授以及現任主任荊志成教授。現有在職醫師45名，其中教授13名，副教授17名，主治醫師15名，技術員11名。在職博士研究生導師6人，碩士研究生導師10人，每年培養研究生20余人、進修生10余人。心內科是中國醫師協會心血管病學專科醫師培訓基地及國家衛健委醫院管理所冠心病介入診療及電生理介入診療培訓基地，還設有高血壓、冠心病、心律失常、心力衰竭、肺血管病等特色門診 。目前心內科每年收治住院患者約近4000例，年門診患者約10萬余人次 。
自建科以來，心內科專家教授在各個醫學專業學會有著廣泛的社會兼職并多次獲得國家表彰，為全國學科的發展做出了突出貢獻。其中，方圻教授曾任中華醫學會副會長和中華醫學會內科學會主任委員，吳寧教授曾任中華醫學會心血管病學分會主任委員和中華醫學會心電生理與起搏分會副主任委員。張抒揚教授現任中華醫學會內科學分會副主任委員、中國醫師協會心內科醫師分會候任會長、國家罕見病診療與保障委員會主任委員和中華醫學會心血管病專業委員會常委兼秘書長等。
目前心內科全體醫護人員正以全新的面貌，團結一致，大踏步走向新時代，為協和新百年譜寫新的篇章。
